क्लिनिकल परीक्षण जर्नल
खुला एक्सेस

अमूर्त

क्वांटिटेटिव रियल-टाइम पीसीआर का उपयोग करके वैक्सीनियम ब्रेक्टीएटम थुनब के फल विकास में जीन अभिव्यक्ति विश्लेषण के लिए संदर्भ जीन का सत्यापन

फेंग हे*, लियांगज़िआन गुई, यान झांग, बो झू, जियाओपिंग झांग, मिन शेन, फेंगयिंग वान, लू यांग, जियाक्सिन जिओ*

पृष्ठभूमि: वैक्सीनियम ब्रैक्टेटम थुनब (VBT) पूर्वी और दक्षिणी चीन के पहाड़ी क्षेत्रों में व्यापक रूप से वितरित है। VBT की पत्तियों का बहुत अधिक चिकित्सीय महत्व है और इसका उपयोग चावल को रंगने के लिए किया जा सकता है, जिससे "वुमिफान" का उत्पादन होता है। इसके फलों में भी भरपूर पोषक तत्व होते हैं। हालाँकि, VBT की आणविक सामग्री की खोज पर सीमित ध्यान दिया गया है। पहले, हमने तीन विशिष्ट VBT फलों पर RNA-seq का प्रदर्शन किया था जो पकने के विभिन्न चरणों में थे, हालाँकि सत्यापन में एक विश्वसनीय संदर्भ जीन खो गया था।

परिणाम: इस अध्ययन में, हमने पिछले अध्ययनों और ट्रांसक्रिप्टोमिक्स विश्लेषणों के आधार पर दस उम्मीदवार संदर्भ जीन का चयन किया। इसके बाद, इन जीनों का मूल्यांकन व्यापक रैंकिंग मूल्यांकन के साथ जीनोर्म, नॉर्मफाइंडर और बेस्टकीपर सहित कई तरीकों के संयोजन का उपयोग करके किया गया। परिणामस्वरूप, हमने पाया कि एक्टिन2, एनएडीएच और एडीके जीन में फलों के विकास में शामिल जीनों के अभिव्यक्ति स्तरों का विश्लेषण करने के लिए उच्च विश्वसनीयता है। इसके अलावा, ट्रांसक्रिप्टोमिक विश्लेषण से 15 डीईजी के ट्रांसक्रिप्ट स्तरों का मूल्यांकन एनएडीएच को संदर्भ जीन के रूप में उपयोग करके किया गया था, और आरटी-क्यूपीसीआर डेटा ट्रांसक्रिप्टोमिक डेटा के साथ अत्यधिक सुसंगत थे।

निष्कर्ष: ये परिणाम जीन अभिव्यक्ति के आगे के अध्ययन के लिए एक विश्वसनीय संदर्भ जीन प्रदान करते हैं, जो VBT के व्यापक अन्वेषण के लिए लाभदायक होगा।