ल्यूकेमिया का जर्नल
खुला एक्सेस

अमूर्त

Utilization of Next-Generation Deep Sequencing to Analyze BCR-ABL1 Kinase Domain Mutation for Imatinib-Resistant Chronic Myeloid Leukemia Patients in Vietnam

Duong CQ, Nguyen C, Nguyen TT, Nguyen LV, Pham HQ, Trinh HTT, Tran HC, Le TQ, Pham HT, Hong TH, Nguyen TH, Truong HN, Bach KQ and Nguyen TA

पृष्ठभूमि: क्रोनिक माइलॉयड ल्यूकेमिया एक क्लोनल माइलोप्रोलिफेरेटिव नियोप्लाज्म है, जिसकी विशेषता क्रोमोसोमल ट्रांसलोकेशन टी (9; 22) (q34; q11) की उपस्थिति है। यह 95% से अधिक मामलों में पाया जाता है और इसके परिणामस्वरूप BCR-ABL1 फ्यूजन प्रोटीन में उच्च टायरोसिन किनेज गतिविधि होती है। पिछले दशकों के दौरान, इमैटिनिब और टायरोसिन किनेज अवरोधक की अन्य पीढ़ियों का उपयोग रोग के लक्ष्य उपचार के लिए प्रभावी रूप से किया गया है। हालाँकि, BCR-ABL1 फ्यूजन जीन के किनेज डोमेन के भीतर उत्परिवर्तन के कारण हाल ही में कई दवा प्रतिरोधी मामले सामने आए हैं। इस घटना के बारे में और जानकारी प्रदान करने के लिए, हमने डीप सीक्वेंसिंग द्वारा किनेज डोमेन उत्परिवर्तन का विश्लेषण करने के लिए 141 इमैटिनिब-प्रतिरोधी क्रोनिक माइलॉयड ल्यूकेमिया रोगियों का पूर्वव्यापी अध्ययन किया। 20 अनुपचारित रोगियों के एक और समूह को नियंत्रण के रूप में जोड़ा गया। विधियाँ: अस्थि मज्जा कोशिकाओं से आरएनए निकाला गया और उसके बाद सीडीएनए संश्लेषण किया गया। बीसीआर-एबीएल1 फ्यूजन जीन के काइनेज डोमेन को बढ़ाने के लिए नेस्टेड पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन किया गया। प्रवर्धित उत्पादों का आकार, सांद्रता की निगरानी की गई और डीएनए अनुक्रमण लाइब्रेरी तैयार की गई। अनुक्रम विश्लेषण इल्युमिना मिसेक सीक्वेंसर और सीक्वेंस पायलट सॉफ्टवेयर का उपयोग करके किया गया। अनुक्रमण परिणामों को सैंगर अनुक्रमण के लिए यादृच्छिक रूप से चुना गया था। परिणाम: नियंत्रण समूह में से कोई भी काइनेज डोमेन उत्परिवर्तन के साथ सकारात्मक नहीं था। 141 रोगियों में से 47 (33%) में कम से कम एक न्यूक्लियोटाइड प्रतिस्थापन पाया गया। अनुक्रमण परिणामों की पुष्टि सैंगर अनुक्रमण द्वारा भी की गई। उन 47 नमूनों में से, 28 प्रकार के 72 न्यूक्लियोटाइड प्रतिस्थापन, परिवर्तित 24 कोडन की पहचान की गई। उनमें से, Y253F/H, M351T, G250E, F359V/I और M244V सबसे अधिक बार होने वाले उत्परिवर्तन थे, जबकि T315I में केवल 4.1% उत्परिवर्तन हुए। कई नमूनों में कई प्रतिस्थापन और नए बदलाव भी थे। निष्कर्ष: अगली पीढ़ी की डीप सीक्वेंसिंग काइनेज डोमेन उत्परिवर्तन का पता लगाने के लिए एक संवेदनशील और प्रभावी तरीका है और हमारे परिणाम क्रोनिक माइलॉयड ल्यूकेमिया में दवा-प्रतिरोध उत्परिवर्तन के बारे में और जानकारी प्रदान कर सकते हैं।