ट्रांसक्रिप्टोमिक्स: ओपन एक्सेस
खुला एक्सेस

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ल्यूकेना ल्यूकोसेफाला का ट्रांसक्रिप्टोम विश्लेषण और जड़ों और टहनियों में अत्यधिक अभिव्यक्त जीन की पहचान

काज़ुए एल. इशिहारा, माइकल डीएच होंडा, डंग टी. फाम, दुलाल बोरठाकुर

ल्यूकेना ल्यूकोसेफाला (ल्यूकेना) एक तेजी से बढ़ने वाला वृक्ष फलीदार पौधा है जो विभिन्न अजैविक और जैविक तनावों के प्रति अत्यधिक सहनशील है। उच्च तापमान और लंबे समय तक सूखे का सामना करने और रोग-मुक्त पौधे के रूप में विकसित होने की अपनी क्षमताओं के कारण, यह तनाव प्रतिरोध की आनुवंशिकी की जांच करने के लिए एक दिलचस्प मॉडल पौधा है। उच्च-स्तरीय तनाव प्रतिरोध जड़ में कुछ जीनों की उच्च अभिव्यक्ति के साथ सहसंबद्ध हो सकता है, जो पोषक तत्व और पानी के अवशोषण और मिट्टी जनित रोगजनकों द्वारा संक्रमण के लिए प्राथमिक स्थल है। इस अध्ययन का उद्देश्य ल्यूकेना के ट्रांसक्रिप्टोम को चिह्नित करना और जड़-विशिष्ट जीनों की पहचान करना था जो सूखा सहिष्णुता और रोग प्रतिरोध में शामिल हो सकते हैं। ल्यूकेना के ट्रांसक्रिप्टोम का विश्लेषण इल्युमिना-आधारित अनुक्रमण और डे नोवो असेंबली के माध्यम से किया गया, जिसने क्रमशः जड़ और टहनी से 62,299 और 61,591 यूनिजीन (≥ 500 बीपी) उत्पन्न किए। 4 x 180,000 माइक्रोएरे विश्लेषण के माध्यम से, जड़ और टहनी के बीच 10,435 यूनिजीन की अभिव्यक्ति की तुलना की गई। जड़ में अपरेगुलेटेड अनुक्रमों को ज्यादातर उन यूनिजीन द्वारा दर्शाया गया था जो द्वितीयक चयापचय से संबंधित थे, जबकि टहनी में, अपरेगुलेटेड अनुक्रमों को ज्यादातर उन यूनिजीन द्वारा दर्शाया गया था जो कार्बोहाइड्रेट और लिपिड चयापचय में शामिल थे। टेरपेनॉइड बायोसिंथेसिस जीन और निकोटियानामाइन सिंथेस जीन के साथ समरूपता साझा करने वाले यूनिजीन जड़ में 100 गुना से अधिक अपरेगुलेटेड थे, जो दर्शाता है कि इन जीनों की ल्यूकेना की उच्च तनाव सहिष्णुता में महत्वपूर्ण भूमिका हो सकती है। जड़ और टहनी में सक्रिय रूप से प्रतिलेखित अनुक्रमों की सूची बनाने से ल्यूकेना में सूखा सहिष्णुता और रोग प्रतिरोध के लिए जीन की पहचान हो सकेगी।