एंटीवायरल और एंटीरेट्रोवाइरल जर्नल
खुला एक्सेस

अमूर्त

एंटीवायरल के लिए लक्ष्य के रूप में वेसिकुलर स्टोमेटाइटिस वायरस ग्लाइकोप्रोटीन और डैनसिलकैडेवरिन की डॉकिंग

अर्पिता बनर्जी और सारा एस चेरियन

रैबडोवायरस में वेसिकुलर स्टोमेटाइटिस वायरस (वीएसवी) और रेबीज वायरस और चांदीपुरा वायरस जैसे उल्लेखनीय मानव रोगजनक शामिल हैं। लक्ष्य रिसेप्टर्स और बाइंडिंग साइट पहचान का मॉडलिंग नए चिकित्सीय एजेंट विकसित करने में एक महत्वपूर्ण कदम है। झिल्ली संलयन मार्ग के प्रोटीन से चुनिंदा रूप से जुड़ने वाले लिगैंड वायरल प्रवेश को धीमा या अवरुद्ध कर सकते हैं। इस अध्ययन में, वीएसवी के सतह ग्लाइकोप्रोटीन जी को संभावित एंटीवायरल लक्ष्य के रूप में चुना गया था। डैनसिलकैडेवरिन, रिमैंटाडाइन और अमैंटाडाइन ज्ञात अवरोधक हैं जो वीएसवी आंतरिककरण को रोकने के लिए दिखाए गए हैं, हालांकि उनके अवरोध का आणविक तंत्र अच्छी तरह से समझा नहीं गया है। इन लिगैंड की संलयन अवरोधकों के रूप में क्षमता का पता इन-सिलिको बाइंडिंग साइट पहचान और डॉकिंग अध्ययनों के द्वारा लगाया गया था। जी ट्रिमर इंटरफ़ेस में एक लिगैंड बाइंडिंग पॉकेट की भविष्यवाणी की गई थी। डॉकिंग पर, डैनसिलकैडेवरिन ने प्रोटीन के संरचनात्मक संक्रमण के लिए आवश्यक अवशेष स्ट्रेच के साथ ऊर्जावान रूप से अनुकूल संपर्क बनाए, जबकि रिमांटाडाइन और अमांटाडाइन बाइंडिंग पॉकेट में डॉक करने में विफल रहे। हमारे परिणाम बताते हैं कि डैनसिलकैडेवरिन प्रीफ्यूजन संरचना में जी प्रोटीन को स्थिर करके वायरल प्रवेश को रोक सकता है। इस अध्ययन के निष्कर्षों को उसी परिवार के अन्य वायरस के खिलाफ एंटीवायरल डिजाइन करने के लिए बढ़ाया जा सकता है।