ट्रांसक्रिप्टोमिक्स: ओपन एक्सेस

ट्रांसक्रिप्टोमिक्स: ओपन एक्सेस
खुला एक्सेस

आईएसएसएन: 2329-8936

अमूर्त

अधिक सहनशील चावल की खोज: लौह की उच्च सांद्रता वैकल्पिक स्प्लिसिंग को कैसे प्रभावित करती है?

अर्तुर टेक्सेरा डी अराउजो जूनियर, डेनियल दा रोजा फरियास, रेल्सन श्रेइनर्ट डॉस सैंटोस, मार्सेलो नोगीरा डो अमरल, लुइस विलियन पाचेको अर्गे, डेनिएला डी कैसिया ओलिवेरा, सोलेंज फरेरा दा सिल्वेरा सिल्वेरा, रोजेरियो ओलिवेरा डी सूसा, यूजेनिया जसीरा बोलासेल ब्रागा, लुसियानो कार्लोस दा मैया और एंटोनियो कोस्टा डी ओलिवेरा

चावल (ओरिज़ा सातिवा एल.) एक वैश्विक प्रधान खाद्य फसल है और पौधों के अध्ययन के लिए एक महत्वपूर्ण मॉडल जीव है। हाल की रिपोर्टों से पता चला है कि वैकल्पिक स्प्लिसिंग कई तनावपूर्ण स्थितियों से प्रभावित होती है, जो प्रतिकूल वातावरण के अनुकूलन के लिए इसके महत्व का सुझाव देती है। इस विषय पर कम जानकारी होने के कारण, इस अध्ययन का उद्देश्य पोषक घोल में उच्च लौह सांद्रता की प्रतिक्रिया में होने वाले स्प्लिसिंग पैटर्न में परिवर्तनों का पता लगाना था। यहाँ हमने 300 mg L-1 Fe+2 की सांद्रता के साथ लौह की अधिकता के तहत एक अपेक्षाकृत सहनशील चावल की किस्म BRS Querência के ट्रांसक्रिप्टोम में विभिन्न प्रकार के जंक्शनों और स्प्लिसिंग घटनाओं की मात्रा निर्धारित की। मानक स्थितियों (नियंत्रण) के तहत रखे गए पौधों में 127,781 अलग-अलग स्प्लिसिंग जंक्शन मौजूद थे, जबकि तनावग्रस्त पौधों में 123,682 अलग-अलग जंक्शन थे। नियंत्रण और तनावग्रस्त पौधों में क्रमशः विहित (98.85% और 98.91%), अर्ध-विहित (0.73% और 0.70%) और गैर-विहित (0.42% और 0.40%) जंक्शन पाए गए। इंट्रोन प्रतिधारण सबसे अधिक बार होने वाली घटना थी (44.1% और 47.4%), इसके बाद क्रमशः नियंत्रण और तनावग्रस्त पौधों में 3' स्प्लिस साइट (22.6% और 21.9%), एक्सॉन स्किपिंग (18.9% और 17.3%) और वैकल्पिक 5' स्प्लिस साइट (14.4% और 13.4%) थी। हमें 25 अलग-अलग अभिव्यक्त जीन (पांच ऊपर और 20 नीचे विनियमित) भी मिले जो अनुवादोत्तर संशोधनों से संबंधित हैं। ये परिणाम इस बात को समझने में एक महत्वपूर्ण कदम का प्रतिनिधित्व करते हैं कि आयरन सहनशील जीनोटाइप में पौधे तनाव प्रतिक्रियाएं कैसे होती हैं

अस्वीकरण: इस सार का अनुवाद कृत्रिम बुद्धिमत्ता उपकरणों का उपयोग करके किया गया था और अभी तक इसकी समीक्षा या सत्यापन नहीं किया गया है।
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