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संपीड़न संवेदी दृष्टिकोण के आधार पर जीन अभिव्यक्ति और सीएनवी डेटा के संयोजन द्वारा ग्लियोमा का उपप्रकारण।

संजय शर्मा

हाल ही में, जैव-रणनीतियों की उन्नति ने विशेषज्ञों को एक परीक्षा से विभिन्न प्रकार की जानकारी एकत्र करने की अनुमति दी है, उदाहरण के लिए, गुणवत्ता अभिव्यक्ति जानकारी, एसएनपी जानकारी, और प्रतिलिपि संख्या भिन्नता (सीएनवी) जानकारी। किसी भी व्यक्तिगत जानकारी का उपयोग करने की तुलना में विभिन्न प्रकार की जानकारी को जोड़ने पर एक बेहतर परिणाम तैयार किया जा सकता है। जीनोम-व्यापी अनुमानों के विभिन्न डेटा प्रकारों के साथ संयुक्त जांच एक नया विचार नहीं है, लेकिन जैविक प्रकटीकरण के लिए उन्हें कुशलतापूर्वक कैसे एकीकृत किया जाए, यह लगातार परीक्षण कर रहा है। डिम्बग्रंथि के कैंसर में डीएनए प्रतिकृति संख्या और अभिव्यक्ति जानकारी की एकीकृत जांच के लिए मैगेलन नामक एक ऑनलाइन मंच का निर्माण किया गया था। गुणवत्ता अभिव्यक्ति और रोगी सहनशक्ति के बीच उल्लेखनीय संबंध मैगेलन द्वारा पाया गया है। गुणवत्ता क्षमता की भविष्यवाणी करने के लिए विषम सूचना हॉटस्पॉट को जोड़ने के लिए एक बायेसियन संरचना का निर्माण किया। गुणवत्ता समूहों की बेहतर सटीकता को अकेले माइक्रोएरे परीक्षा की तुलना में हासिल किया गया है। विभिन्न जीनोम-व्यापी डेटासेट की संयुक्त जांच में भाग आधारित मापनीय सीखने की गणना का भी उपयोग किया गया था। कुछ संयुक्त जांच रणनीतियों के लिए डेटासेट का एक समान फैलाव होना आवश्यक है; जांच से पहले डेटासेट को एक समान फैलाव में बदलने की आवश्यकता होती है। हाल ही में, BMD को प्रबंधित करने वाले आवेदक गुणों को पहचानने के लिए लिंकेज, गुणवत्ता अभिव्यक्ति और संबद्धता को एकीकृत करने वाली एक एकीकृत पद्धति का लेखा-जोखा किया गया है। इस कार्य में प्रस्तावित समेकित जांच दृष्टिकोण में सूचना प्रकारों या सूचना विनियोगों की कोई विशेष आवश्यकता नहीं है। हमारी कार्यप्रणाली की पर्याप्तता का परीक्षण करने के लिए, हमने इसे गिलोमा के उपप्रकारण पर लागू किया। ग्लियोमा ट्यूमर हैं जो मस्तिष्क या रीढ़ में शुरू होते हैं और ग्लियाल कोशिकाओं से निकलते हैं। वयस्कों में ग्लियोमा सबसे आम प्रकार के आवश्यक मस्तिष्क ट्यूमर हैं। ग्लियोमा का क्रम कोशिका प्रकार, मूल्यांकन और क्षेत्र पर आधारित हो सकता है। उदाहरण के लिए, ट्यूमर के पैथोलॉजिकल मूल्यांकन द्वारा नियंत्रित ग्लियोमा को दूसरे दर्जे और उच्च श्रेणी में व्यवस्थित किया जा सकता है। इस जांच में, हम संदर्भ के अनुसार आनुवंशिक और परमाणु चिह्नों के आधार पर उपप्रकारों को चिह्नित करते हैं। ग्लियोमा उपप्रकारों के क्रम ने बहुत से लोगों का ध्यान आकर्षित किया है और कई शोध समूहों द्वारा इसका अन्वेषण किया गया है। अधिकांश कार्य गुणवत्ता अभिव्यक्ति जानकारी पर आधारित हैं। यह माना गया कि ग्लियोमा के चार उपप्रकार, ऑलिगोडेंड्रोग्लियोमा, एनाप्लास्टिक ऑलिगोडेंड्रोग्लियोमा, एनाप्लास्टिक एस्ट्रोसाइटोमा और ग्लियोब्लास्टोमामल्टीफॉर्म, केवल दो-गुणवत्ता या तीन-गुणवत्ता संयोजनों द्वारा पहचाने जा सकते हैं। इसने 28 ग्लियोब्लास्टोमा और 22 एनाप्लास्टिक ऑलिगोडेंड्रोग्लियोमा को समूहीकृत करने के लिए 20 विशेषताओं वाला एक k-निकटतम मॉडल तैयार किया। यह सुनिश्चित किया गया कि वर्ग