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नोरोवायरस GII.4 वेरिएंट की स्थानिक-समय विकासवादी गतिशीलता

रुता कुलकर्णी, अतुल एम. वालिम्बे, शोभा डी. चितंबर

पृष्ठभूमि: नोरोवायरस (NoVs) दुनिया भर में छिटपुट बचपन के गैस्ट्रोएंटेराइटिस का दूसरा सबसे आम कारण है। GII.4 जीनोटाइप के NoVs वैश्विक स्तर पर प्रमुख हैं और VP1 जीन में निरंतर विकास से गुजरते हैं, प्रमुख कैप्सिड प्रोटीन को एनकोड करते हैं, जिसके परिणामस्वरूप नए वेरिएंट का उद्भव होता है, जिसमें आज तक चौदह GII.4 वेरिएंट की पहचान की गई है। विधियाँ: वर्तमान अध्ययन ने प्रत्येक GII.4 वेरिएंट का प्रतिनिधित्व करने वाले पूर्ण VP1 अनुक्रमों के डेटासेट पर बायेसियन दृष्टिकोण, फ़ाइलोज़ोग्राफ़िक और माइग्रेशन पैटर्न विश्लेषण का उपयोग करके वैश्विक रूप से प्रसारित GII.4 NoVs की स्थानिक-समय विकासवादी गतिशीलता की जाँच की। परिणाम: GII.4 VP1 के लिए अनुमानित औसत विकास दर प्रति वर्ष प्रति साइट 5.1x10-3 न्यूक्लियोटाइड प्रतिस्थापन (उप/साइट/वर्ष) थी, सबसे हाल के सामान्य पूर्वज (tMRCA) का समय ~1971 ​​था, और सबसे संभावित पैतृक स्थान संयुक्त राज्य अमेरिका (USA) था। चौदह ज्ञात GII.4 वेरिएंट ने परिवर्तनशील विकास दर (4.5-7.4x10-3 उप/साइट/वर्ष) और tMRCA (~1984 से ~2006) प्रदर्शित की, जिनमें से अधिकांश का पैतृक स्थान यूएसए/एशिया था। प्रवासन पैटर्न विश्लेषण ने GII.4 नोरोवायरस के वैश्विक प्रसार में ऑस्ट्रेलिया-न्यूजीलैंड, भारत और दक्षिणी यूरोप की महत्वपूर्ण भूमिका का संकेत दिया। निष्कर्ष: अध्ययन GII.4 नोरोवायरस विकासवादी गतिशीलता को समझने में योगदान देता है।