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अमूर्त

बैसिलस हेलोडुरन्स से प्राप्त प्रोटीन के लिए शुद्धिकरण प्रवृत्ति

शाओमिन यान और गुआंग वू

विशेष प्रयोजनों वाले प्रोटीन की मांग में उल्लेखनीय वृद्धि हुई है। ये प्रोटीन आम तौर पर पुनः संयोजक प्रोटीन के माध्यम से प्राप्त किए जाते हैं, हालांकि उनका शुद्धिकरण महंगा और आसान नहीं है। विचाराधीन प्रोटीन पर एक संभावना रखने के लिए पहले से शुद्धिकरण की संभावना का अनुमान लगाने के लिए एक विधि विकसित करना आवश्यक है। प्रोटीन का शुद्धिकरण प्रोटीन के सहज गुणों से संबंधित होना चाहिए जिसमें इसकी 3D संरचना शामिल है, और अब तक लगभग 540 अमीनो एसिड गुण पाए गए हैं। इस प्रकार प्रोटीन शुद्धिकरण की सफल दर के विरुद्ध प्रत्येक अमीनो एसिड गुण का परीक्षण करना संभव है ताकि यह पता लगाया जा सके कि शुद्धिकरण प्रवृत्ति का अनुमान लगाने के लिए कौन सा गुण अधिक उपयुक्त है। इस अध्ययन में, 535 गुणों में से प्रत्येक का परीक्षण लॉजिस्टिक रिग्रेशन और न्यूरल नेटवर्क मॉडल का उपयोग करके बैसिलस हेलोडुरन्स से 438 शुद्ध और 429 असंभव शुद्ध प्रोटीन के विरुद्ध किया गया था। परिणामी संवेदनशीलता और विशिष्टता पर ROC विश्लेषण लागू किया गया था। परिणाम दिखाते हैं कि अमीनो एसिड संरचना गुण आम तौर पर शुद्धिकरण प्रवृत्ति का अनुमान लगाने में कम सहायक थे जबकि अमीनो एसिड भौतिक रासायनिक गुण, द्वितीयक संरचना और गतिशील गुण अधिक उपयोगी थे, और गतिशील गुण अधिक आशाजनक थे। इसलिए प्रोटीन के कई प्रकार के गुण, प्रोटीन की शुद्धिकरण प्रवृत्ति को निर्धारित करने में सहायक हो सकते हैं, तथा इनमें सूक्ष्मजीवविज्ञानी और जैव-तकनीकी क्षेत्रों में लागत को कम करने और उत्पादन में तेजी लाने की क्षमता है।