कीमोथेरेपी: ओपन एक्सेस
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मूत्राशय कैंसर के ट्यूमर माइक्रोएनवायरनमेंट में प्रतिरक्षा कोशिका घुसपैठ से संबंधित एमएमपी9 का पूर्वानुमान मार्कर

हान-शेंग लिन, वान-वान लियू, नेंग-झुओ फेंग, शुआंग-ज़े झोंग, शांग-जिन चेन, जिंग-वेई हे*, जियान लियांग*

पृष्ठभूमि: मूत्राशय कैंसर (बीएलसीए) सबसे आम मानव कैंसर में से एक है, इसकी घटना बढ़ रही है, खासकर महिलाओं में। ट्यूमर माइक्रो एनवायरनमेंट (टीएमई) ट्यूमर के विकास और प्रगति में एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। हमने कैंसर जीनोम एटलस प्रोग्राम डेटाबेस में बीएलसीए की अभिव्यक्ति प्रोफाइल का सर्वेक्षण किया और उन जीनों की जांच की जो ट्यूमर माइक्रो एनवायरनमेंट (टीएमई) की संरचना को प्रभावित कर सकते हैं। फिर हमने जीन और ट्यूमर रोगनिदान के बीच संबंधों का विश्लेषण किया, प्रतिरक्षा रोगनिरोधी मार्करों की तलाश की जो बीएलसीए के निदान और उपचार के लिए नई शैलियों को जन्म दे सकते हैं।

विधियाँ: हमें कैंसर जीनोम एटलस (TCGA) से BLCA का RNA-seq डेटा मिला; इम्यून और स्ट्रोमल स्कोर की गणना करने के लिए घातक ऊतकों की अभिव्यक्ति में स्ट्रोमल और प्रतिरक्षा कोशिकाओं के अनुमान (ESTIMATE) डेटा एल्गोरिदम का उपयोग किया। COX प्रतिगमन विश्लेषण में भिन्न रूप से व्यक्त जीन का प्रदर्शन किया गया और प्रोटीन-प्रोटीन इंटरैक्शन (PPI) नेटवर्क का निर्माण करने के लिए उपयोग किया गया।

परिणाम: इंटरसेक्शन विश्लेषण ने प्रदर्शित किया कि मैट्रिक्स मेटालोप्रोटीनेज-9 ( एमएमपी9 ) एकमात्र क्रॉसओवर जीन है। हमने सेल-टाइप आइडेंटिफिकेशन बाय एस्टिमेटिंग रिलेटिव सब्सेट ऑफ आरएनए ट्रांसक्रिप्ट्स (CIBERSORT) एल्गोरिदम के माध्यम से BLCA में ट्यूमर-घुसपैठ करने वाली प्रतिरक्षा कोशिकाओं (TIC) का प्रतिशत गणना की। TIC में MMP9 के उच्च और निम्न अभिव्यक्ति समूहों में अंतर स्थापित किए गए। फिर प्रत्येक प्रकार के TIC में MMP9 के अभिव्यक्ति स्तरों को सहसंबंधित किया गया। उत्तरजीविता, नैदानिक ​​और संवर्धन विश्लेषणों के माध्यम से , MMP9 को BLCA के लिए एक प्रतिरक्षा रोगनिरोधी कारक पाया गया और ट्यूमर माइक्रोएन्वायरमेंट में एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। अंततः, MMP9 और प्रतिरक्षा जांच बिंदु जीन के बीच सहसंबंध विश्लेषण ने संकेत दिया कि MMP9 BLCA पर इम्यूनोथेरेपी के प्रभाव का पूर्वानुमान लगा सकता है।

निष्कर्ष: MMP9 एक प्रतिरक्षा रोगसूचक मार्कर जीन है। MMP9 कई मार्गों के माध्यम से BLCA की प्रतिरक्षात्मक प्रक्रिया को विनियमित करने में शामिल है और PD-1 और CTLA4 प्रतिरक्षा लक्ष्यों से निकटता से संबंधित है। MMP9 की अभिव्यक्ति BLCA के रोगनिदान को प्रभावित कर सकती है, जो दर्शाता है कि यह BLCA का रोगनिदान-संबंधी मार्कर हो सकता है।