एंटीवायरल और एंटीरेट्रोवाइरल जर्नल
खुला एक्सेस

अमूर्त

मुंबई के एक रोगी समूह में एचआईवी-1 उपप्रकार सी रिवर्स ट्रांसक्रिपटेस और प्रोटीज़ जीन में बहुरूपता

ऋत्विक दहाके, श्रद्धा मेहता, स्नेहा यादव, अभय चौधरी और रंजना ए देशमुख

उद्देश्य: विकसित देश एचआईवी-1 के प्राथमिक/संचारित दवा प्रतिरोध की दरों से चिंतित हैं। एचआईवी-1 उपप्रकार सी उत्परिवर्तन में कुछ बहुरूपताओं की वैधता पर बहस चल रही है, जो आम सहमति उपप्रकार बी अनुक्रमों से संबंधित है और कभी-कभी प्राथमिक प्रतिरोध के रूप में गलत समझी जाती है। इस प्रारंभिक अध्ययन में, हमने मुंबई, भारत में एक रोगी समूह से एचआईवी-1 उपप्रकार सी के रिवर्स ट्रांसक्रिप्टेस (आरटी) और प्रोटीज (पीआर) जीन में बहुरूपता निर्धारित की है।

विधियाँ: अध्ययन चौबीस रोगियों (एंटीरेट्रोवायरल थेरेपी के अनुभवी और साथ ही दवा-अनभिज्ञ) के प्लाज्मा नमूनों के साथ किया गया था, जिसमें 'होम-ब्रू' सेमी-नेस्टेड रिवर्स-ट्रांसक्रिपटेस-पीसीआर का उपयोग किया गया था, जिसके बाद अनुक्रमण और अनुक्रम विश्लेषण किया गया था। पॉलीमॉर्फिज्म और अन्य दवा-प्रतिरोध उत्परिवर्तनों के विश्लेषण और व्याख्या के लिए स्टैनफोर्ड एचआईवी दवा-प्रतिरोध डेटाबेस का उपयोग किया गया था। हमने पीआर जीन के लिए निगरानी दवा प्रतिरोध उत्परिवर्तन (एसडीआरएम) का भी विश्लेषण किया।

परिणाम: PR जीन में 0.1337 ± 0.042 और RT जीन में 0.067 ± 0.014 की उत्परिवर्तन आवृत्ति पर बहुरूपता निर्धारित की गई, जबकि 16.6% और 12.5% ​​नमूनों में क्रमशः PR और RT जीन में दवा-प्रतिरोध उत्परिवर्तन पाए गए। PR जीन के लिए L19, V82, M36, R41, L63, H69, L89 और I93 और RT जीन के लिए D121, K122, T165, K166, K173, D177, T200, Q207 और R211 पर 50% से अधिक प्रतिस्थापन पाए गए। इसके अतिरिक्त, 15.0% नमूनों में PR जीन SDRMs देखे गए।

निष्कर्ष: हमारे निष्कर्ष पिछले निष्कर्षों से सहमत हैं कि भारत से एचआईवी-1 उपप्रकार सी में बहुरूपता मौजूद है और यह दोहराते हैं कि इन बहुरूपताओं में प्रतिरोध से जुड़े कई प्रमुख और छोटे/सहायक उत्परिवर्तन भी शामिल हो सकते हैं। ऑनलाइन उपलब्ध अधिकांश दवा-प्रतिरोध डेटाबेस उपप्रकार बी पर आधारित हैं; इसलिए, हम अनुशंसा करते हैं कि एंटीरेट्रोवाइरल थेरेपी शुरू करने से पहले दवा-प्रतिरोध की नियमित और स्पष्ट निगरानी को सशक्त बनाने के लिए एचआईवी उपप्रकार-विशिष्ट दवा-प्रतिरोध डेटाबेस बनाए जाएं, खासकर प्रोटीज अवरोधकों को शामिल करते समय।