आईएसएसएन: 2161-0932
युताका शोजी, जीवीआर चंद्रमौली और जॉन आई. राइज़िंगर
उन्नत चरण सीरस डिम्बग्रंथि कैंसर एक मेटास्टेटिक बीमारी है जिसका पूर्वानुमान खराब है और जिसके लिए नए उपचारात्मक और रोगनिदान लक्ष्यों की पहचान की आवश्यकता होती है। हमने एफ़िमेट्रिक्स मानव जीनोम U133 प्लस 2.0 जीनचिप ® सरणी का उपयोग करके सामान्य डिम्बग्रंथि सतह उपकला के आठ मामलों की तुलना में 20 उन्नत चरण सीरस डिम्बग्रंथि कैंसर की जीन अभिव्यक्ति की जांच की और कैंसर में LY6/PLAUR डोमेन युक्त 6B (LYPD6B) की अधिक अभिव्यक्ति की पहचान की। LYPD6B का कार्य अज्ञात है, हालांकि, LYPD6B अनुक्रम सांप के जहर के विषाक्त पदार्थों और PLAUR डोमेन के साथ उच्च समानता के एक एमिनो एसिड क्षेत्र को एनकोड करता है, जो आक्रमण और मेटास्टेसिस को विनियमित करने में शामिल जीन में मौजूद एक डोमेन है। हमने तीन LYPD6B mRNA वेरिएंट की पहचान की और उन्हें LYPD6B_a, LYPD6B_b और LYPD6B_c नाम दिया। हमने पाया कि LYPD6B_a वेरिएंट मुख्य रूप से क्वांटिटेटिव रियल टाइम पीसीआर द्वारा लेट स्टेज सीरस ओवेरियन कैंसर में व्यक्त किया जाता है। पुनः संयोजक V5-टैग LYPD6B प्रोटीन के सभी तीन वेरिएंट OVCAR3 ओवेरियन कैंसर कोशिकाओं की कोशिका झिल्ली पर व्यक्त किए जाते हैं। OVCAR3 कोशिकाओं में LYPD6B के mRNA और प्रोटीन के नॉकडाउन में चार अलग-अलग shRNA का उपयोग किया गया था। हालांकि, इन LYPD6B नॉकडाउन कोशिकाओं ने कोशिका आकृति विज्ञान, कोशिका प्रसार और कोशिका प्रवास में कोई परिवर्तन नहीं दिखाया। हमने ओवेरियन कैंसर में कई अन्य LY6/PLAUR डोमेन युक्त ट्रांसक्रिप्ट की नाटकीय रूप से अधिक अभिव्यक्ति देखी। इनमें से, LYPD1 की अभिव्यक्ति LYPD6B की तुलना में अधिक है। संक्षेप में हमने ओवेरियन कैंसर में LYPD6B और LYPD1 की उच्च अभिव्यक्ति की पहचान की और पाया कि ये निदान या रोग निदान उद्देश्यों में या ओवेरियन कैंसर में पुनरावृत्ति के मूल्यांकन के लिए उपयोगी प्रोटीन को एनकोड कर सकते हैं।