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इम्यूनो-इंफॉर्मेटिक्स दृष्टिकोण का उपयोग करके सूडान इबोला वायरस के खिलाफ मल्टी एपिटोप पेप्टाइड वैक्सीन की भविष्यवाणी

अहमद हमदी अबू-हराज़ * , खुबीब अली अब्द-एलरहमान, मोजाहिद सलाह इब्राहिम, वलीद हसन हुसैन, मोहम्मद सिद्दीग मोहम्मद, मारवान मुस्तफा बदावी और मोहम्मद अहमद सलीह

सूडान इबोला वायरस फिलोवायरस फिलोविरिडे परिवार से संबंधित एकल स्ट्रैंडेड नेगेटिव सेंस आरएनए जीनोम है जो रक्तस्रावी बुखार का कारण बनता है। इसके लिए कोई उपचार या टीका नहीं है, इसलिए इस अध्ययन का उद्देश्य SUDV के सभी स्ट्रेन के ग्लाइकोप्रोटीन का विश्लेषण करने के लिए इम्यूनोइन्फॉर्मेटिक्स दृष्टिकोण का उपयोग करके एक पेप्टाइड वैक्सीन तैयार करना है, ताकि संरक्षित क्षेत्र का निर्धारण किया जा सके जिसका आगे अध्ययन करके सभी संभावित एपिटोप्स की भविष्यवाणी की जा सके जिन्हें पेप्टाइड वैक्सीन के रूप में इस्तेमाल किया जा सकता है। NCBI डेटाबेस से प्राप्त कुल 21 सूडान इबोला वायरस ग्लाइकोप्रोटीन को संरक्षण निर्धारित करने और IEDB विश्लेषण संसाधन का उपयोग करके एपिटोप्स की भविष्यवाणी करने के लिए संरेखित किया गया था। बी सेल (PPPPDGVR, ETFLQSPP, LQSPPIRE) के लिए पेप्टाइड वैक्सीन के रूप में तीन एपिटोप्स की भविष्यवाणी की गई। टी सेल के लिए चार एपिटोप्स ने MHC वर्ग I (FLYDRLAST, IIIAIIALL, MHNQNALVC और RTYTILNRK) के प्रति उच्च आत्मीयता दिखाई और सूडान और पूरी दुनिया की आबादी के खिलाफ उच्च कवरेज दिखाया। MHC वर्ग II में भी, चार एपिटोप्स जो सबसे अधिक बार पाए जाने वाले MHC वर्ग II एलील (FAEGVIAFL, FLRATTELR, FLYDRLAST और FVWVIILFQ) के साथ बातचीत करते हैं, सूडान और पूरी दुनिया की आबादी के खिलाफ उच्च कवरेज के साथ। हम इन अनुमानित एपिटोप्स की पेप्टाइड वैक्सीन के रूप में प्रभावशीलता साबित करने के लिए इन विवो और इन विट्रो अध्ययन की सलाह देते हैं।