आंतरिक चिकित्सा: खुली पहुंच
खुला एक्सेस

अमूर्त

पीसीआर-आरएफएलपी का उपयोग करके आणविक टाइपिंग से एलवोरी कोस्ट, कोट डी आइवर (पश्चिम अफ्रीका) में बुरुली अल्सर के पर्यावरणीय माइकोबैक्टीरिया एजेंट की विविधता का पता चलता है।

क्विनेट ग्रेगोइरे, काकोउ नगाज़ोआ ई सोलेंज, अका न्गुएटा, वाकौ सबाइन, कूलिबली नगोलो डेविड, कौआकोउ हेलेन, सिल्ला अबूबकर, फेय-केट हॉर्टेंस, औसी सर्ज, डोसो मिरेइले

बुरुली अल्सर माइकोबैक्टीरियम अल्सरेंस (एमयू) के कारण होने वाला एक उपेक्षित त्वचा रोग है, और दुनिया भर में और विशेष रूप से अफ्रीकी देशों में हर साल 1000 लोगों को प्रभावित करता है। ग्रामीण स्थानिक क्षेत्रों में प्रारंभिक निदान की कमी और राष्ट्रीय स्वास्थ्य देखभाल प्रणाली में रोग की अज्ञातता के कारण बुरुली अल्सर का उन्मूलन मुश्किल है। मध्य और पश्चिमी अफ्रीका के ग्रामीण आर्द्रभूमि और दलदलों में, बच्चे सबसे अधिक प्रभावित होते हैं। एमयू पर्यावरणीय माइकोलैक्टोन उत्पादक माइकोबैक्टीरिया (एमपीएम) से संबंधित है और परिसंचारी उपभेदों की उच्च आनुवंशिक विविधता प्रस्तुत करता है। पोलीमरेज़ चेन रिएक्शन (पीसीआर) द्वारा संस्कृति और जीनोम का पता लगाने के द्वारा निदान लागू किया गया था। एमयू के लिए नैदानिक ​​​​और पर्यावरणीय नमूनों की पुष्टि करने के लिए पीसीआर एक स्वर्ण विधि बन गई। MIRU-VNTR विधि और प्रतिबंध खंड लंबाई बहुरूपता (RFLP) को MIRU-VNTR मार्करों के साथ संयुक्त रूप से विभिन्न स्रोतों से माइकोबैक्टीरिया को अलग करने के लिए उपयोग किया गया था। इस अध्ययन का उद्देश्य संयुक्त MIRU-VNTRTyping और RFLP का उपयोग करके पर्यावरण, संस्कृति उपभेदों और नैदानिक ​​नमूनों से विभिन्न माइकोबैक्टीरिया स्रोतों की आणविक विविधता की जांच करना था। स्थानिक स्थलों से कुल 26 नमूने (पानी, तलछट, माइकोबैक्टीरिया उपभेद और स्वाब) की पहली बार IS2404 या ज़ीहल-नील्सन धुंधलापन द्वारा पुष्टि की गई थी। नमूनों का विश्लेषण 4 विशिष्ट मार्करों (MIRU-1, VNTR6, VNTR19, ST-1) के लिए PCR टाइपिंग द्वारा किया गया और एम्पलीकॉन्स को MspI प्रतिबंध एंडोन्यूक्लिऐस के साथ पचाया गया और PCR-RFLP विश्लेषण के लिए 3% एगरोज जेल वैद्युतकणसंचलन द्वारा अलग किया गया। हमारे परिणामों ने VNTR-MIRU-टाइपिंग द्वारा विभिन्न प्रवर्धन दिखाया। ST-1 में कल्चर स्ट्रेन के लिए 71.4% तक सबसे अच्छा प्रवर्धित मार्कर था, जबकि क्लिनिकल नमूनों में सभी मार्करों के लिए 62.5% तक अच्छी प्रवर्धन दर है। क्लिनिकल नमूनों के PCR-RFLP-प्रोफाइल एक जैसे थे, जबकि पर्यावरण और माइकोबैक्टीरिया स्ट्रेन ने अलग-अलग PCR-RFLP-प्रोफाइल दिखाए। हमने पर्यावरण जांच के लिए स्थानिक देशों में गैर-तपेदिक माइकोबैक्टीरिया की जीनोटाइपिंग की पुष्टि करने के लिए एक PCR-RFLP संवेदनशील, आसान और सस्ता तरीका विकसित किया है। हम VNTR-MIRU अनुक्रम के दोहराए गए लोकी में उत्परिवर्तन और पर्यावरण से मानव में माइकोबैक्टीरिया के अनुकूलन का सुझाव देते हैं। यह अध्ययन आइवरी कोस्ट में माइकोबैक्टीरिया के कई जीनोटाइप के संचलन की पुष्टि करता है।