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स्तन कैंसर के आणविक प्रोफाइल का मेटाजीनोमिक विश्लेषण जिनी नामक साहित्य आधारित जीन प्राथमिकता निर्धारण उपकरण का उपयोग करके: एक नवीन दृष्टिकोण

अमित कुमार यादव और विद्या झा

पृष्ठभूमि: स्तन कैंसर की जैविक जटिलता और विविधता को आणविक प्रोफ़ाइल द्वारा समझाया जा सकता है। माइक्रोएरे तकनीक इसका अध्ययन करने के लिए पसंदीदा तरीका है। लेकिन इसकी कुछ सीमाएँ हैं। कम्प्यूटेशनल तकनीक जीन अभिव्यक्ति प्रोफ़ाइल का अध्ययन करने की एक नई विधि है।

सामग्री और विधि: मेडलाइन, एनसीबीआई जीन और होमोलोजीन डेटाबेस से साहित्य, जीन और होमोलॉजी जानकारी का विश्लेषण करने के लिए जिनी, एक स्वतंत्र रूप से उपलब्ध वेब आधारित सॉफ्टवेयर का उपयोग किया गया था। दिए गए इनपुट लक्ष्य प्रजाति (होमो सेपियंस) और बायोमेडिकल विषय (स्तन कैंसर) थे। दिए गए इनपुट के अनुसार लक्ष्य प्रजातियों के जीन को प्राथमिकता दी जाती है।

परिणाम: 1906 रिपोर्ट किए गए जीन को दी गई रैंकिंग अपेक्षित लाइनों के अनुरूप नहीं थी। इसलिए, उन्हें हिट की संख्या के अनुसार मैन्युअल रूप से फिर से रैंक किया गया। इन्हें 70 तक सीमित कर दिया गया। इन जीनों द्वारा एन्कोड किए गए प्रोटीन और उनके कार्यों को NCBI डेटाबेस से प्राप्त किया गया था। कार्सिनोजेनेसिस में उनके कार्य और भूमिका के आधार पर इन जीनों को फिर अलग-अलग श्रेणियों में एक साथ रखा गया।

निष्कर्ष: स्तन कैंसर के आणविक प्रोफाइल का अध्ययन करने के लिए एक नया कम्प्यूटेशनल दृष्टिकोण प्रदर्शित किया गया है। स्तन कैंसर के जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल का अध्ययन करने के लिए 70 जीनों का एक पैनल सुझाया गया है। ये जीन स्तन कैंसर के आणविक रोगजनन के सभी पहलुओं का व्यापक मूल्यांकन करते हैं और भविष्य के नैदानिक ​​अध्ययनों के लिए अनुशंसित हैं।