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इंटीग्रेटिव बायोलॉजी 2016: फोल्डबैक इंटर कॉइल डीएनए- ब्युंग-डोंग किम- सियोल नेशनल यूनिवर्सिटी

ब्युंग-डोंग किम

फोल्डबैक इंटर कॉइल (FBI) DNA डुप्लेक्स DNA का एक पूरी तरह से अनूठा और अस्थायी विन्यास है जिसमें 4 व्यावहारिक भाग शामिल हैं: फोल्डबैक हेड, इंटर कॉइल स्टेम, इंटर कॉइल ब्लंट क्विट टेल और हेटेरोडुप्लेक्स। FBI DNA को पहली बार पर्ल बाजरा एमटी DNA के असामान्य TEM विन्यास में देखा गया था और DNA के क्षेत्र-भरने वाले संस्करण का उपयोग करके इसकी व्यवहार्यता के लिए जांच की गई थी। FBI DNA को डुप्लेक्स DNA के एक स्थान पर फोल्डबैक बेंडिंग का उपयोग करके आकार दिया जाता है, ताकि फ़्लैंकिंग एंटी-पैरेलल डबल हेलिक्स को हर अलग मुख्य खांचे में एक दूसरे से जुड़ने के लिए निर्देशित किया जा सके ताकि एक इंटर कॉइल का आकार दिया जा सके। इंटर कॉइल के भीतर दोहराए गए अनुक्रम 4-स्ट्रैंडेड बेस पेयरिंग बनाते हैं। दोहराव के बेस फ़्लिपिंग के परिणामस्वरूप हेटेरोडुप्लेक्स गठन और समरूप पुनर्संयोजन होता है। एफबीआई डीएनए आकार में डबल हेलिक्स का यह फैला हुआ परिवर्तन 4 मुख्य डीएनए-डीएनए लेनदेन की मध्यस्थता में सहायक है, अर्थात्, प्रत्यक्ष पुनरावृत्तियों की सहायता से α विलोपन, उल्टे दोहरावों की सहायता से Ω वेब पेज-विशिष्ट व्युत्क्रमण, वेब पेज-विशिष्ट प्रविष्टि में एफबीआई टिप प्रविष्टि और ट्रांसपोज़िशन में गैर-समरूप छोड़ो शामिल होना और छेद भरना (ईएचईजे-जीएफ)। सबसे महत्वपूर्ण बात यह है कि हेटेरोडुप्लेक्स में एफबीआई डीएनए का रूपांतरण डीएनए प्रतिकृति के बाद बेटी स्ट्रैंड के पैरानेमिक पृथक्करण का एक शक्तिशाली तंत्र देता है जो किसी भी अन्य मामले में प्रतिकृति कांटे पर एक प्लेक्टोनेमिक डबल हेलिक्स डीएनए को खोलने के बाद फंस सकता है।

Biochemical and bioinformatics evidences withinside the literature that aid the FBI DNA for the inevitable presence and running withinside the actual biology may be presented. Put collectively, attention of the dynamic and numerous transformations of the FBI DNA shape might permit a brand-new knowledge of numerous DNA function, their interplay at genome stage and at cell differentiation. Suggestions for destiny studies techniques might be discussed. Foldback inter coil (FBI) DNA is shaped with the aid of using the folding lower back at one factor of a non-helical parallel tune of double-stranded DNA at as sharp as 180° and the intertwining of double helixes inside every different principal groove to shape an inter coil with a diameter of 2.2 nm. FBI DNA has been counselled to mediate intra-molecular homologous recombination of a deletion and inversion. Inter-molecular homologous recombination, referred to as web page-particular insertion, on the opposite hand, is mediated with the aid of using the direct perpendicular method of the FBI DNA tip, because the attP web page, onto the goal DNA, because the attB web page. Transposition of DNA transposons entails the pairing of terminal inverted repeats and 5-7-bp tandem goal duplication. FBI DNA configuration efficiently explains easy in addition to replicative transposition, alongside the involvement of an enhancer detail. The majority of numerous retro transposable factors that hire a goal web page duplication mechanism is likewise counselled to comply with the FBI DNA-mediated perpendicular insertion of the paired inter coil ends with the aid of using non-homologous quit-becoming a member of, collectively with hole filling.

A genome-extensive angle of transposable factors in mild of FBI DNA is discussed. The transposable detail (TE) became first defined with the aid of using McClintock as a controlling detail that jumps from one role to some other withinside the maize chromosome withinside the mid- 1940s, lengthy earlier than the invention with the aid of using Watson and Crick of the double helix shape of DNA as a genetic detail. It became a time whilst, after the rediscovery of Mendel’s Law of Heredity in 1900, the cytogenetic look at of chromosomes became at the vanguard of genetics and whilst genes have been concept to be beads on a string positioned at the chromosome. It became withinside the overdue Nineteen Seventies and early Eighties whilst insertion series (IS) factors and transposons (Tn) have been observed and observed to be much like McClintock’s controlling factors, and her AC/DS factors have been showed on the DNA series stage as a TE. Salient functions of DNA transposable factors (dTEs), which include terminal inverted repeats (TIRs), goal web page duplication (TSD), the transposase gene, and easy and replicative transposition mechanisms were properly installed with the aid of using great molecular biology and biochemistry studies. Then, unfashionable transposable factors (rTEs), which include lengthy terminal repeat (LTR)-retrotransposons, non- LTR-retrotransposons, and different unfashionable-factors, have been being delivered to the repertoire because the Eighties to make the image numerous and complicated.

TE के कई नए परिवार वितरित किए जा रहे हैं, मुख्य रूप से यूकेरियोट्स से, यहां तक ​​कि पोस्ट-जीनोम युग में कम्प्यूटेशनल स्क्रीनिंग का उपयोग करने की सहायता से, जिसने उनके सिस्टम और ट्रांसपोज़िशन के तंत्र पर आधारित एक नए प्रकार की आवश्यकता को जन्म दिया है। फोल्डबैक इंटर कॉइल (FBI) DNA की उपस्थिति का उल्लेख पहली बार 1985 में किम द्वारा किया गया था और व्युत्क्रम और विलोपन के इंट्रा-मॉलिक्यूलर होमोलॉगस पुनर्संयोजन की मध्यस्थता करने के लिए एक क्षेत्र भरने वाले संस्करण का उपयोग करके सिद्ध किया गया था। यह 1987 में भी सिद्ध हुआ कि FBI DNA अंतर-आणविक DNA पुनर्व्यवस्था, साथ ही वेब पेज-विशिष्ट सम्मिलन, फोल्डबैक टिप पर और उदासीन dTE के इंटर कॉइल क्विट पर DNA ट्रांस पोजिशनल एकीकरण की मध्यस्थता कर सकता है। इस मूल्यांकन पर यह परीक्षण किया जा सकता है कि ट्रांसपोज़िशन की FBI DNA मध्यस्थता को rTE के असाधारण प्रशिक्षण और परिवारों तक कैसे बढ़ाया जा सकता है। यह मूल्यांकन प्रतिकृति विवरण को कम करेगा और उन यांत्रिक कार्यों पर ध्यान केंद्रित करेगा जो डीएनए ट्रांसपोज़िशन के तंत्र के लिए एफबीआई डीएनए की उपयोगिता पर लागू होते हैं। टीएसडी प्रत्येक डीटीई और आरटीई के लिए ट्रांसपोज़िशन तंत्र पर सामंजस्य के एक सामान्य स्थान मील के पत्थर के रूप में कार्य करता है। अब तक का सबसे बड़ा अपवाद हेलिट्रॉन सुपरफ़ैमिली है, जिसमें टीएसडी की कमी है और एक रोलिंग सर्कल प्रतिकृति संस्करण का उपयोग करता है। जब तक मेजबान गुणसूत्र में टीई एकीकरण के दौरान एक टीएसडी उत्पन्न होता है, तब तक यह दर्शाता है कि एकीकरण का तत्काल मध्यवर्ती एक डबल-स्ट्रैंडेड डीएनए आकार में है, भले ही आरएनए या सिंगल-स्ट्रैंडेड डीएनए प्रारंभिक मध्यवर्ती हो।

यह कार्य आंशिक रूप से 18-20 जुलाई, 2016 बर्लिन, जर्मनी में आयोजित चौथे अंतर्राष्ट्रीय एकीकृत जीव विज्ञान सम्मेलन ^में प्रस्तुत किया गया है।