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प्रतिरक्षा घुसपैठ से संबंधित बायोमार्करों की पहचान करने के लिए जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल का एकीकृत विश्लेषण: एंडोमेट्रियोसिस के घाव में

ज़ियांग काँग*, ताउंग शियाओ

हाल के अध्ययनों ने एंडोमेट्रियोसिस (ईएम) के रोगजनन और प्रगति में प्रतिरक्षा प्रणाली की महत्वपूर्ण भूमिका का संकेत दिया है। इस अध्ययन का उद्देश्य बहु-जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण के माध्यम से प्रतिरक्षा कोशिका घुसपैठ के हस्ताक्षर और ईएम के प्रतिरक्षा-संबंधी नैदानिक ​​बायोमार्कर की पहचान करना है। ईएम के सामान्य डेटासेट की गणना करने वाले xCell एल्गोरिदम के माध्यम से, हमने पाया कि मैक्रोफेज और न्यूट्रोफिल एंडोमेट्रियम ऊतक में सबसे अधिक घुसपैठ करने वाली प्रतिरक्षा कोशिकाएँ हैं। हमने ईएम घावों और सामान्य एंडोमेट्रियम के बीच 816 अलग-अलग व्यक्त जीन (डीईजी) की पहचान की। हमने प्रतिरक्षा-संबंधी हब मॉड्यूल की पहचान करने के लिए भारित जीन सह-अभिव्यक्ति नेटवर्क विश्लेषण (WGCNA) का भी निर्माण किया। हब मॉड्यूल, डीईजी और प्रतिरक्षा-संबंधी जीन के वेन आरेख ने ईएम (TNFSF13B, IL7R, CSF1R और LEP) के चार प्रतिरक्षा-संबंधी हब जीन की पहचान की, जो सभी नियंत्रण की तुलना में ईएम के घावों में काफी हद तक विनियमित थे। इसके अलावा, हमने अपने परिणामों को मान्य करने के लिए कई स्वतंत्र डेटासेट का उपयोग किया। रोग निदान के लिए उन हब जीनों के आरओसी वक्र (एयूसी) के तहत क्षेत्र 0.8 से अधिक था। हमने यह भी पाया कि वे हब जीन ईएम की सामान्य जटिलता बांझपन से जुड़े हुए थे।