क्लिनिकल और सेलुलर इम्यूनोलॉजी जर्नल
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अमूर्त

इम्यूनोइन्फॉर्मेटिक्स-पेप्टाइड संचालित वैक्सीन और डुवेनहेज रेबीज वायरस ग्लाइकोप्रोटीन जी के लिए सिलिको मॉडलिंग

सहर ओबी अब्द अलबागी, ​​उमर हाशिम अहमद, मनाल अब्दुल्ला गुमा, खुबीब अली अब्द_एलरहमान, अहमद हमदी अबू-हराज़ और मोहम्मद ए. हसन

पृष्ठभूमि: डुवेनहेज रेबीज वायरस लिसावायरस जीनस परिवार रैबडोविरिडे से संबंधित है, जो घातक संक्रमण का कारण बनता है, जिसका कोई प्रभावी उपचार उपलब्ध नहीं है और आज तक कोई लाइसेंस प्राप्त डीएनए या पेप्टाइड वैक्सीन नहीं है। वर्तमान अध्ययन का उद्देश्य डुवेनहेज रेबीज वायरस के लिए पेप्टाइड वैक्सीन की भविष्यवाणी करना था।
विधियाँ और सामग्री: डुवेनहेज वायरस के अनुक्रमों को NCBI से चुना गया था, और फिर इसे IEDB से कई B सेल और T सेल परीक्षणों के अधीन किया गया ताकि सबसे आशाजनक पेप्टाइड्स का पता लगाया जा सके जो संचालित-पेप्टाइड वैक्सीन के रूप में कार्य कर सकते हैं। IEDB का उपयोग करके चयनित पेप्टाइड्स के लिए जनसंख्या कवरेज विश्लेषण किया गया और अंत में MHC1 अणुओं के साथ बातचीत को देखने के लिए होमोलॉजी मॉडलिंग और आणविक डॉकिंग अध्ययन किए गए।
परिणाम और निष्कर्ष: टी सेल-टेस्ट के लिए परीक्षण किए गए पेप्टाइड्स में से, इस अध्ययन ने टी सेल (YFLIGVSAV) के एक दिलचस्प एपिटोप को पेश किया जो दुनिया में 99.36% जनसंख्या कवरेज के माध्यम से अठारह एलील के साथ बंधन के अलावा, MHC-वन और MHC-टू एलील के लिए मजबूत संकेतक के रूप में बंधन आत्मीयता के सभी उपभोग को प्रदर्शित करता है। इन परिणामों को आणविक डॉकिंग अध्ययनों द्वारा आगे समर्थन मिला जो परीक्षण किए गए पेप्टाइड्स के बीच सबसे कम बंधन ऊर्जा के साथ MHC होमो स्पिन अणु के साथ उत्कृष्ट बातचीत दिखाते हैं।
केवल तीन बी सेल एपिटोप (AHYK, YTIPDKL और SLHNPYPDSH) ग्लाइकोप्रोटीन जी की सतह पर रैखिक होने और एंटीजेनिक होने के कारण सभी किए गए बी सेल परीक्षणों को ओवरलैप करते पाए गए।