आईएसएसएन: 2165-7548
जोसेफ एफ एनडिसांग
अमूर्त
आज तक केन्या में डायोस्कोरिया (यम) एक उपेक्षित फसल है, भले ही भोजन के रूप में और औषधि स्रोत के रूप में फार्मास्यूटिक्स में इसकी क्षमता हो। उपेक्षित फसलों पर शोध, विशेष रूप से डायोस्कोरिया, वैज्ञानिक समुदाय और नीति निर्माताओं को इसके बारे में संवेदनशील बनाने का एक निश्चित तरीका है। विभिन्न प्रजातियों के कई वायरस यम ( डायोस्कोरिया एसपीपी ) को संक्रमित करने की सूचना मिली है । हालाँकि, यम को संक्रमित करने वाले वायरस की पूरी विविधता का पता लगाया जाना बाकी है।
उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण (एचटीएस) और पीओएक्स मार्कर विधियों का उपयोग पौधों में नए पादप वायरल जीनोम और चयापचय प्रक्रियाओं की खोज में उत्तरोत्तर किया जा रहा है।
इस अध्ययन में, मैं यह निर्धारित करने के लिए रतालू पर एचटीएस का उपयोग करूंगा कि क्या कोई अनदेखा वायरस मौजूद होगा जो रतालू जर्मप्लाज्म के अंतर्राष्ट्रीय वितरण को प्रतिबंधित करेगा। खोज मौजूद एक नए वायरस अनुक्रम की खोज पर काम करेगी। इकतीस (31) रतालू के नमूनों का परीक्षण किया जाएगा और उन्हें अस्थायी रूप से वायरस "यम वायरस वाई" (वाईवीवाई) नाम दिया गया है। चयापचय प्रतिक्रिया जो उत्परिवर्तन ला सकती है उसे पेरोक्सीडेज मार्कर का उपयोग करके परीक्षण किया जाएगा क्योंकि वे जीव के चयापचय में अरबियोडिसिस प्रक्रिया को प्राप्त करते हैं। दो वाईवीवाई वायरल आइसोलेट्स के पूर्ण जीनोम अनुक्रमों को इकट्ठा किया जाएगा और पांच ओपन रीडिंग फ्रेम (ओआरएफ) को टेक्स्ट करने के लिए आगे की खोज की जाएगी। ORF1 एक बड़े प्रतिकृति-संबंधित प्रोटीन को एनकोड करता है, ORF2, ORF3 और ORF4 कथित ट्रिपल जीन ब्लॉक प्रोटीन का गठन करते हैं बीटाफ्लेक्सिविरिडे परिवार की प्रजातियों के सीमांकन मानदंड को ध्यान में रखते हुए, YVY को बीटाफ्लेक्सिविरिडे परिवार में एक नई वायरस प्रजाति के रूप में माना जाना चाहिए। इस नए वायरस के किसी भी लक्षण और उपज हानि के साथ संबंध और वायरस-मुक्त बीज रतालू उत्पादन पर इसके प्रभाव को समझने के लिए आगे की खोज कार्य की आवश्यकता होगी।
कीवर्ड: आरएनए-सीक; वायरस का पता लगाना; बीटाफ्लेक्सिविरिडे; अगली पीढ़ी का अनुक्रमण; एचटीएस
यह कार्य 24-25 जून, 2020 को औषधीय पौधों और समुद्री दवाओं पर 6वें विश्व सम्मेलन (औषधीय पौधे 2020- वेबिनार) में प्रस्तुत किया जा रहा है
परिचय
यम ( डायोसेरिया एसपीपी), जो पूर्वी अफ्रीका में उगाई जाने वाली सबसे महत्वपूर्ण निर्वाह फसलों में से एक है, एक वार्षिक उष्णकटिबंधीय कंद फसल है जिसमें 25-30% ऊर्जा सामग्री होती है। इसलिए यम पूर्वी अफ्रीका में उगाई जाने वाली सबसे महत्वपूर्ण निर्वाह फसलों में से एक है जिसे उपेक्षित किया गया है।
वायरल रोग, जो अक्सर कई संक्रमणों के रूप में हो सकते हैं, रतालू उत्पादन पर एक बड़ी बाधा हैं, और पौधे के विकास में बाधा उत्पन्न कर सकते हैं, पत्तियों में कमी, कंद ऊर्जा की मात्रा में कमी, और व्यक्तिगत पौधों में, 93% तक की उपज हानि हो सकती है। जबकि 140 वायरस प्रजातियों के सदस्य प्राकृतिक या कृत्रिम रूप से रतालू को संक्रमित कर सकते हैं, इनमें से केवल बारह प्रजातियाँ अब तक अफ्रीका में पाई गई हैं, जिनमें से केवल तीन पूर्वी अफ्रीकी से रिपोर्ट की गई हैं। इन बारह प्रजातियों में से आठ में वायरस बीजजनित होते हैं, जो एक ऐसा कारक है जो उनके प्रभावी नियंत्रण को गंभीर रूप से बाधित करता है। उदाहरण के लिए, बीज संचरण YV के लिए २%, वायरस के लिए ६.९% - यम मोज़ेक वायरस (YMV) का एक प्रकार, और ककड़ी मोज़ेक वायरस (cMV;) के लिए १३.३% तक पहुँच सकता है। यह देखते हुए कि यम-संक्रमित वायरस की एक व्यापक विविधता अफ्रीका में अन्य जगहों पर खोजी गई है, यह संभावना है कि केन्या में अतिरिक्त यम-संक्रमित वायरस की खोज की जानी बाकी है। इस देश में यम को संक्रमित करने वाले वायरस के बारे में सीमित उपलब्ध जानकारी बीमारियों के नियंत्रण में बाधा डालती है, विशेष रूप से रोग-मुक्त बीजों के उत्पादन और वायरस प्रतिरोधी यम किस्मों के निर्माण के संबंध में। इसलिए, इस अध्ययन का मुख्य उद्देश्य एचटीएस और पीओएक्स मार्कर के उपयोग से केन्या में यम के नए वायरस की विविधता की आगे जांच करना है।
समस्या का विवरण
केन्या में खेती के तहत डायोस्कोरिया प्रजाति का सवाल इस अध्ययन का आधार बना। इस अध्ययन का उद्देश्य डीएनए और आरएनए न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमों का उपयोग करके आणविक फाइलोजेनी के माध्यम से इसे हल करना था, जो उन्हें ज्ञात अफ्रीकी प्रजातियों और जीन बैंक में जानकारी वाली प्रजातियों से जोड़ता है। अध्ययन में रतालू में नए वायरस को भी लक्षित किया गया है जो रतालू की चयापचय प्रतिक्रिया में बाधा डालता है, जिसके परिणामस्वरूप डायोस्कोरिन का स्तर कम हो जाता है, जिसमें बहुत सारा प्रोटीन होता है जो रतालू के पोषण मूल्य को बढ़ाता है।
औचित्य
डायोस्कोरिया भोजन के लिए और अपनी औषधीय क्षमता के कारण एक महत्वपूर्ण फसल है। केन्या और विश्व स्तर पर डायोस्कोरिया वर्गीकरण रूपात्मक लक्षण वर्णन के आधार पर वर्गीकरणकर्ताओं के लिए बहुत चुनौतीपूर्ण रहा है। डायोस्कोरिया प्रजाति वर्गीकरण में कठिनाई के कई कारण जुड़े हुए हैं। सबसे पहले, डायोस्कोरिया वर्गीकरण एक प्रजाति के भीतर वर्गीकरण चरित्र की जटिलता और प्लास्टिसिटी के कारण चुनौतीपूर्ण है, इसलिए उनकी पहचान करना मुश्किल है और पर्यावरणीय परिवर्तनों के कारण वायरस ने वायरस और याम में उत्परिवर्तन लाया है। दूसरा, डायोस्कोरिया वैश्विक स्तर पर शोधकर्ताओं द्वारा एक उपेक्षित फसल रही है। प्रजनन उद्देश्यों के लिए प्रजातियों का स्पष्ट विभेदन अत्यंत महत्वपूर्ण है। किसी दिए गए जीव की प्रजातियों का मानचित्रण न केवल संरक्षण उद्देश्यों के लिए बल्कि प्रजनन उद्देश्यों के लिए भी आवश्यक है ।