सैद्धांतिक और कम्प्यूटेशनल विज्ञान जर्नल
खुला एक्सेस

अमूर्त

पुरानी दुनिया और नई दुनिया के बंदरों के विचलन के बाद मानव वंश में मानव माइक्रो आरएनए जीन भंडार का विस्तार

रीको एफ किकुनो

यह व्यापक रूप से माना जाता है कि माइक्रो आरएनए (miRNA) ने यूमेटाज़ोअन विकास के दौरान रूपात्मक जटिलता प्राप्त करने में एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाई है, क्योंकि द्विपक्षीय और कशेरुकियों के जीनोम में अधिक जटिलता के साथ miRNA के भंडार में लगातार वृद्धि हुई है। विशेष रूप से, मानव में miRNA भंडार में नाटकीय रूप से विस्तार हुआ है। प्राइमेट विकास की प्रक्रिया के दौरान miRNA में कैसे बदलाव आया, इसकी जांच करने के लिए, हमने यूथेरियन स्तनधारियों के विचलन के बाद, मानव वंश के साथ 1,527 वर्तमान मानव miRNA के विकासवादी मूल का अनुमान लगाया। हमने छह गैर-मानव प्राइमेट प्रजातियों में ज्ञात और अनुमानित कार्यात्मक ऑर्थोलॉग्स की उपस्थिति और अनुपस्थिति के आधार पर miRNA जीन की एक विकासवादी प्रोफ़ाइल बनाई: चिम्पांजी, गोरिल्ला, ऑरंगुटान, गिब्बन, मैकाक और मार्मोसेट और तीन प्रतिनिधि यूथेरियन स्तनधारी: गोजातीय, कुत्ता और चूहा। कार्यात्मक ऑर्थोलॉग्स का पूर्वानुमान कई जीनोम अनुक्रम संरेखण और BLAST खोजों द्वारा लगाया गया था, इसके बाद चार फ़िल्टरिंग चरण किए गए। पुरानी दुनिया के बंदरों की वंशावली में miRNA जीन और जीन परिवारों की संख्या में भारी वृद्धि हुई, नई दुनिया के बंदरों के साथ आम पूर्वज से विचलन के बाद, प्राइमेट विकास के पहले चरण की तुलना में लगभग सात गुना अधिक दर पर। होमिनोइड्स में miRNA और जीन परिवारों के विस्तार की दर में थोड़ी गिरावट आई है। प्रत्येक विकासवादी अवधि में प्राप्त जीन परिवारों के साथ जीन की संख्या की तुलना ने सुझाव दिया कि जीन दोहराव के बजाय, नए miRNA जीन की पीढ़ी में काफी योगदान दिया।