सैद्धांतिक और कम्प्यूटेशनल विज्ञान जर्नल
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अमूर्त

सी.के.डी. अभिव्यक्ति डेटा के सिलिको आधारित विश्लेषण से मधुमेह मेलिटस के साथ सहसंबंध में बायोमार्कर जीन का पता चला

मो. मुर्शाद अहमद, सफिया ताज़ीन, आफताब आलम, अनम फारूकी, शाहनवाज अली, मोहम्मद जुबैर मलिक और रोमाना इशरत

क्रोनिक किडनी रोग (CKD) दुनिया भर में एक व्यापक सार्वजनिक स्वास्थ्य समस्या बन रही है। रोग की वर्तमान चिंता अंतर्निहित रोगजनकता के परिवर्तन के कारण हो सकती है। हमारे अध्ययन का उद्देश्य मधुमेह के साथ सहसंबंध में CKD के माइक्रोएरे जीन अभिव्यक्ति डेटा का विस्तृत विश्लेषण और बायोमार्कर जीन की पहचान प्रदान करना था। यहाँ, CKD और मधुमेह के क्रमशः 22 और 69 नमूनों में भिन्न रूप से व्यक्त जीन की पहचान करने के लिए Affymetrix अभिव्यक्ति सरणियों का उपयोग किया गया था। यह CKD अवस्था में देखे गए कुछ प्रमुख जैविक परिवर्तनों को रेखांकित करता है और GEO डेटासेट (GSE70528, GSE11045) का उपयोग करके Affymetrix जीन चिप के गुणवत्ता मूल्यांकन के संचालन के लिए विशिष्ट प्रक्रियाओं को दर्शाता है और विस्तृत विश्लेषण के लिए विज़ुअलाइज़ेशन को दर्शाने के लिए गुणवत्ता नियंत्रण पैकेजों को भी दर्शाता है। हमने CKD में 912 और मधुमेह में 629 भिन्न रूप से व्यक्त जीन की पहचान की। मधुमेह के साथ CKD की व्यापक तुलना से, हमें 80 सामान्य जीन मिले, जिनमें से 29 ऊपर विनियमित और 51 नीचे विनियमित पाए गए। इसके अलावा, इन 80 जीनों के एनसीजी के साथ विश्लेषण में, 10 सामान्य जीन विभिन्न प्रकार के कैंसर में शामिल पाए गए। इस प्रकार, परिणाम इन 10 सामान्य भिन्न रूप से व्यक्त जीनों के महत्व पर जोर देते हैं, जिन्हें मधुमेह, सी.के.डी. और कैंसर तीन स्थितियों के लिए बायोमार्कर के रूप में माना जाता है। हमारे अध्ययनों ने भिन्न रूप से व्यक्त जीनों को सूचीबद्ध किया है जो सी.के.डी. के रोगजनन में महत्वपूर्ण भूमिका निभा सकते हैं और बायोमार्कर के रूप में काम कर सकते हैं।