एंटीवायरल और एंटीरेट्रोवाइरल जर्नल
खुला एक्सेस

अमूर्त

हेपेटाइटिस बी वायरस जीनोटाइप ई उपभेदों के सिलिको विश्लेषण से उपचार से अनजान मध्य अफ़्रीकी रोगियों के संपूर्ण जीनोम में महत्वपूर्ण उत्परिवर्तन का पता चला

गिस्कार्ड विलफ्रेड कोयावेदा, रोज़लिन मचारिया, जूलियट रोज़ ओंगस, यूनिस माचुका, रोजर पेले, नार्सिस पैट्रिस कोमास*

पृष्ठभूमि: हेपेटाइटिस बी वायरस (एचबीवी) वर्तमान में लागू की गई रोकथाम और उपचार उपायों के बावजूद एक गंभीर स्वास्थ्य समस्या बनी हुई है। मध्य अफ्रीकी गणराज्य (सीएआर) में प्रसारित होने वाले उपभेदों के आणविक लक्षण वर्णन पर बहुत कम डेटा है। यहाँ, हमने सीएआर रोगियों से अलग किए गए एचबीवी के पूर्ण-लंबाई वाले जीनोम को अनुक्रमित किया।

कार्यप्रणाली: सीरम के नमूने इंस्टीट्यूट पाश्चर डी बांगुई में एकत्र किए गए थे। पूर्ण लंबाई वाले वायरल जीनोम को चार ओवरलैपिंग प्राइमरों के साथ सेंगर तकनीक का उपयोग करके अलग किया गया और अनुक्रमित किया गया। जैव सूचना विज्ञान उपकरणों का उपयोग करके उत्परिवर्तन और दवा प्रतिरोध के लिए सिलिको में अनुक्रमों का विश्लेषण किया गया।

परिणाम: चार पूर्ण लंबाई वाले HBV जीनोम को सफलतापूर्वक अनुक्रमित किया गया। सभी चार आइसोलेट्स जीनोटाइप E से संबंधित थे और इनमें रिवर्स ट्रांसक्रिपटेस (RT) फंक्शनल डोमेन A में rtI90L उत्परिवर्तन था। एक आइसोलेट में S-ORF के 3' छोर पर एक निरर्थक उत्परिवर्तन था, जिसके कारण समय से पहले स्टॉप कोडन और तीनों सतह प्रोटीन (बड़े, मध्यम और छोटे सतह एंटीजन) के लिए छोटे प्रोटीन अनुक्रमों का उत्पादन हुआ। सिलिको विश्लेषण से पता चला कि इसी उत्परिवर्ती आइसोलेट में RT फंक्शनल डोमेन D में एक rtH234N उत्परिवर्तन भी था, जो बंधन ऊर्जा को बढ़ाता है और एडेफोविर और टेनोफोविर के लिए कम आत्मीयता की ओर ले जाता है।

निष्कर्ष: हेपेटाइटिस बी जीनोटाइप ई सीएआर में प्रसारित होने वाला प्रमुख जीनोटाइप है। हमने सीएआर एचबीवी स्ट्रेन के आरटी जीन में उत्परिवर्तन की पहचान की है और यह उत्परिवर्तन दवा प्रतिरोध से जुड़ा हो सकता है। इसलिए, सीएआर में प्रसारित एचबीवी स्ट्रेन में एचबीवी आरटी की आगे और गहन जांच की आवश्यकता है।