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क्या एंटीजन पुनर्प्राप्ति तकनीक फॉर्मेलिन फिक्स्ड पैराफिन एम्बेडेड ऊतक से डीएनए उत्पादन में सुधार करती है?

सुभाष गोवेन्दर और रिचर्ड नायडू

इस अध्ययन में फॉर्मेलिन फिक्स्ड पैराफिन एम्बेडेड (FFPE) ऊतकों से उच्च गुणवत्ता वाले DNA के निष्कर्षण के लिए इष्टतम प्रोटोकॉल निर्धारित करने हेतु चर pH पर विभिन्न पुनर्प्राप्ति समाधानों के साथ प्रेशर कुकिंग के उपयोग की जांच की गई। इसके अलावा, ऊतक ब्लॉकों की आयु के संबंध में संग्रहीत FFPE ऊतकों पर ऑक्सीकरण प्रभाव का भी पता लगाया गया। अध्ययन का मुख्य उद्देश्य 11 गैस्ट्रिक कैंसर पर इस तकनीक की जांच करना था। हमारे अध्ययन का डिज़ाइन FFPE ऊतकों से निकाले गए DNA की गुणवत्ता में सुधार करने के लिए पारंपरिक प्रेशर कुकर का उपयोग करके एंटीजन पुनर्प्राप्ति तकनीक के सिद्धांतों पर आधारित था। गैस्ट्रिक कैंसर के अलावा, ऊतक पूर्वाग्रह को खत्म करने के लिए लिम्फोमा, स्तन, प्रोस्टेटिक और कोलोरेक्टल कार्सिनोमा का उपयोग किया गया था। परीक्षण किए गए सभी समाधानों के साथ औसत डीएनए सांद्रता में वृद्धि हुई, लेकिन उपयोग किए गए 4 पुनर्प्राप्ति समाधानों में से 3 में डीएनए उपज काफी अधिक थी। प्रेशर कुकिंग द्वारा प्रदान किए गए उच्च दबाव और तापमान पर एंटीजन पुनर्प्राप्ति समाधानों का उपयोग FFPE ऊतकों में फॉर्मेलिन के क्रॉसलिंकिंग प्रभाव को उलटने में सक्षम हो सकता है। इसके अलावा, यह अवलोकन कि हाल ही में संसाधित ब्लॉकों से निकाले गए डीएनए की उपज पुराने ऊतक ब्लॉकों के विपरीत बेहतर थी, इस बात की पुष्टि करता है कि ऑक्सीकरण का डीएनए पर खराब प्रभाव पड़ता है।