एप्लाइड माइक्रोबायोलॉजी: ओपन एक्सेस
खुला एक्सेस

अमूर्त

माइकोबैक्टीरियम कैम्बोडिएंसिस प्रजाति के एक क्लिनिकल स्ट्रेन का विवरण , माइकोबैक्टीरियम सिमिया कॉम्प्लेक्स का एक नया सदस्य

Fatah Tazerart, Jamal Saad, Muriel Militello, Sophie Alexandra Baron, Michel Drancourt*, Sylvain Godreuil*

संदिग्ध नैदानिक ​​तपेदिक से पीड़ित 25 वर्षीय कम्बोडियन पुरुष रोगी से ब्रोंकोस्कोपी द्वारा एक ब्रोन्कोएल्वियोलर लैवेज नमूना एकत्र किया गया था और उसे लोवेनस्टीन-जेन्सन माध्यम में टीका लगाया गया था। तेजी से बढ़ने वाले, गैर-क्रोमोजेनिक ग्राम-पॉजिटिव और एसिड-फास्ट बैक्टीरिया की कॉलोनियों की जांच की गई। स्कैनिंग इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी ने 1.2 ± 0.29 μm-लंबे और 0.58 ± 0.07 μm-बड़े बेसिली दिखाए, जिन्हें नियमित मैट्रिक्स-सहायता प्राप्त लेजर डिसोर्प्शन आयनीकरण-टाइम ऑफ फ्लाइट-मास स्पेक्ट्रोमेट्री और फेनोटाइपिक परीक्षणों (API ^® ZYM, API ^® Coryne और Biolog ^® फेनोटाइप माइक्रोएरे परख) का उपयोग करके पहचाना नहीं जा सका। इन विट्रो में, आइसोलेट आइसोनियाज़िड, एमिकासिन और ट्राइमेथोप्रिम-सल्फामेथोक्साज़ोल के प्रति संवेदनशील था। संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण ने 5,703,981-बीपी ड्राफ्ट जीनोम प्राप्त किया, जिसमें 5,207 कोडिंग-प्रोटीन जीन और 56 पूर्वानुमानित आरएनए जीन के साथ 69.3% जीसी सामग्री प्रदर्शित की गई, जिसमें 3 आरआरएनए शामिल थे। आरपीओबी अनुक्रम ने माइकोबैक्टीरियम सिमिया कॉम्प्लेक्स में माइकोबैक्टीरियम पैरास्क्रोफुलैसियम के साथ 93% अनुक्रम समानता दिखाई। जीनोम अनुक्रम-व्युत्पन्न डीएनए-डीएनए संकरण, ऑर्थोएएनआई और पैन-जीनोमिक विश्लेषण ने पुष्टि की कि यह अलगाव एम. सिमिया कॉम्प्लेक्स के भीतर एक अवर्णित प्रजाति का प्रतिनिधित्व करता है। इस प्रजाति का नाम इसके अलगाव के स्रोत के नाम पर माइकोबैक्टीरियम कैम्बोडिएंसिस रखा गया। इस अलगाव को कलेक्शन डे सोचेस डे ल'यूनिटे डेस रिकेट्सिस (सीएसयूआर) में CSURP9652 नंबर के साथ जमा किया गया था।