आईएसएसएन: 2471-9552
डेयू चेन, पेंग हान, और फेंग यांग*
उद्देश्य: इस अध्ययन को कोलोरेक्टल कैंसर (सीआरसी) प्रतिरक्षा माइक्रोएन्वायरमेंट का एक मजबूत विश्लेषण करने के लिए डिज़ाइन किया गया था ताकि विशिष्ट जीन और मार्गों की पहचान की जा सके जिन्हें अधिक प्रभावी इम्यूनोथेरेपी परिणामों को प्राप्त करने के प्रयास में लक्षित किया जा सके।
विधियाँ: पाँच स्वतंत्र डेटा सेटों का उपयोग करते हुए, हमने 29 विभिन्न प्रतिरक्षा हस्ताक्षरों से जुड़े अभिव्यक्ति प्रोफाइल का विश्लेषण किया, और हमने इन प्रोफाइलों का उपयोग उनकी प्रतिरक्षा सूक्ष्म पर्यावरणीय संरचना के आधार पर सीआरसी नमूनों के पदानुक्रमित क्लस्टरिंग को निर्देशित करने के लिए किया।
परिणाम: हम अपने CRC नमूनों को इस आधार पर समूहीकृत करने में सक्षम थे कि क्या उन्होंने ट्यूमर क्लीयरेंस (क्रमशः इम्युनिटी-एच, इम्युनिटी-एम और इम्युनिटी-एल) से जुड़े प्रतिरक्षा कोशिका प्रकारों द्वारा घुसपैठ के उच्च, मध्यम या निम्न स्तर को प्रदर्शित किया था। इम्युनिटी-एच उपसमूह के नमूनों ने उच्च स्ट्रोमल स्कोर, उच्च प्रतिरक्षा स्कोर और कम ट्यूमर शुद्धता के साथ एक "गर्म" प्रतिरक्षा माइक्रोएनवायरनमेंट प्रदर्शित किया। माइक्रोसैटेलाइट अस्थिरता (MSI) समूह में इम्युनिटी-एच के अधिकांश नमूने शामिल थे, जबकि अधिकांश इम्युनिटी-एम और इम्युनिटी-एल नमूनों को माइक्रोसैटेलाइट स्थिरता (MSS) में शामिल किया गया था। KRAS उत्परिवर्तन वाले अधिकांश रोगी इम्युनिटी-एल और MSS समूहों में थे, जबकि BRAF V600E उत्परिवर्तन प्रदर्शित करने वाले अधिकांश रोगी इम्युनिटी-एच और MSI-एच नमूनों में पाए गए। TMB उच्च नमूनों में इम्युनिटी-एच के अधिकांश नमूने और इम्युनिटी-एम नमूनों का एक छोटा उपसमूह शामिल था। इम्यूनिटी-एच बनाम इम्यूनिटी-एल नमूनों की तुलना करने पर एलसीके, जीएनजीटी2, सीडी3जी, सीसीआर4 और सीसीआर5 टी कोशिका सक्रियण, लिम्फोसाइट विभेदन और ल्यूकोसाइट कोशिका-कोशिका आसंजन सहित मार्गों में महत्वपूर्ण रूप से समृद्ध पाए गए।