जर्नल ऑफ़ मेडिकल डायग्नोस्टिक मेथड्स
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अमूर्त

वंशानुगत कोलोरेक्टल कैंसर के लिए अगली पीढ़ी के अनुक्रमण पैनल परीक्षण का नैदानिक ​​सत्यापन

फ़र्बर एमजे, पीटरसन एलएम, ब्लोमेल जेएच, फ़ेड्रा एनएम, थॉमस बीसी, एट अल

पृष्ठभूमि: अगली पीढ़ी के अनुक्रमण (NGS) का अनुप्रयोग नैदानिक ​​आणविक निदान उद्योग में क्रांति ला रहा है। ऐसा होने पर, NGS प्रक्रियाओं को मान्य करने के लिए दिशा-निर्देश सीमित, गैर-विशिष्ट और तेज़ी से विकसित हो रहे हैं। NGS सत्यापन परियोजनाएँ जटिल और महंगी हैं, इसलिए सत्यापन प्रयोगों पर सावधानीपूर्वक विचार किया जाना चाहिए, जबकि यह सुनिश्चित किया जाना चाहिए कि सभी वर्तमान और विकसित हो रही विनियामक आवश्यकताओं को पूरा किया जाए।

विधियाँ: हमने 16-जीन वंशानुगत कोलोरेक्टल कैंसर NGS पैनल के लिए एक एंड-टू-एंड जेनेटिक परीक्षण प्रक्रिया को मान्य किया। वैश्विक कार्य प्रवाह को हमारे लक्षित क्षेत्रों के 100% के लिए उच्च गुणवत्ता वाले अनुक्रमण डेटा प्रदान करने के लिए डिज़ाइन किया गया था। परीक्षण किए गए परख पैरामीटर सटीकता, परिशुद्धता, रिपोर्ट करने योग्य सीमा, संदर्भ सीमा, विश्लेषणात्मक संवेदनशीलता और विश्लेषणात्मक विशिष्टता थे।

परिणाम: 115 नमूनों को शामिल करते हुए, पांच इंस्ट्रूमेंट रन आयोजित किए गए, एक एंड-टू-एंड प्रक्रिया सत्यापन के माध्यम से। परख के NGS भाग की समग्र सटीकता 99.98% थी। एकल न्यूक्लियोटाइड वैरिएंट पहचान सटीकता 100% थी। एक से आठ न्यूक्लियोटाइड के INDELs के लिए सम्मिलन/विलोपन वैरिएंट (INDEL) पहचान सटीकता 100% थी और NGS द्वारा कुल मिलाकर (एक से 14 न्यूक्लियोटाइड की सीमा) 97% थी। 100% की संवेदनशीलता के लिए हमारे डेटा सेट में कोई गलत नकारात्मक नहीं था।

निष्कर्ष: नैदानिक ​​सेटिंग में एनजीएस की सापेक्ष नवीनता और तेजी से विकसित हो रहे बाहरी मार्गदर्शन को देखते हुए, नैदानिक ​​प्रयोगशालाओं को एनजीएस परीक्षणों को डिजाइन, विकसित, मान्य और लागू करने के लिए अपनी स्वयं की रणनीति विकसित करनी चाहिए। हमारे अनुभव एक चुनी हुई रणनीति के साथ-साथ एनजीएस के कुछ लाभों और सीमाओं पर प्रकाश डालते हैं।