ट्रांसक्रिप्टोमिक्स: ओपन एक्सेस
खुला एक्सेस

अमूर्त

क्लिविया मिनिएटा में चाल्कोन सिंथेस (सीएचएस) और एंथोसायनिडिन सिंथेस (एएनएस) जीन का लक्षण वर्णन और अभिव्यक्ति विश्लेषण

अचिलोनु सी कॉनराड और मालेका एफ मथबाथा

चाल्कोन सिंथेस (CHS) और एंथोसायनिडिन सिंथेस (ANS) पौधों में एंथोसायनिन के उत्पादन के लिए जिम्मेदार प्रमुख एंजाइमों में से हैं। वे आम तौर पर बहु-जीन परिवारों द्वारा एन्कोड किए जाते हैं, जिनमें से कुछ परिवार रंग रंजकता में योगदान करते हैं। अध्ययन ने क्लिविया मिनिएटा में CHS और ANS जीन की जांच की; जिसके फूल के ऊतकों में रंग परिवर्तन होता है। RNA से cDNA को पुष्प ऊतकों से अलग किया गया और अगली पीढ़ी की अनुक्रमण तकनीक का उपयोग करके छोटी अनुक्रम लंबाई के तीन यूनिजीन (CmiCHS 11996, CmiCHS 43839 और CmiANS) को शुरू में प्राप्त किया गया। CHS और ANS के अप्रकाशित प्रारंभिक छोटे अनुक्रमों से जीन-विशिष्ट प्राइमर डिज़ाइन किए गए थे। PCR के बाद प्रवर्धित cDNA की लंबाई CmiCHS 11996 (933 bp), CmiCHS 43839 (951 bp) और CmiANS (983 bp) थी। CHS जीन के लिए 390 एमिनो एसिड डिड्यूस्ड प्रोटीन (AEN04070) के पूर्वानुमानित प्रोटीन के अनुरूप ORF फ़्रेम का अनुवाद किया गया, और ANS जीन (AGD99672) के संबंध में 355 एमिनो एसिड का पूर्वानुमान लगाया गया। सिलिको विश्लेषण से पता चला कि गणना किए गए आणविक भार और सैद्धांतिक आइसोइलेक्ट्रिक पॉइंट (pI) CmiCHS 11996 और CmiCHS43839 क्रमशः 31.0 kDa - 6.95 और 34.6 kDa - 7.54 थे। उत्पाद बंधन स्थल और सक्रिय स्थल के महत्वपूर्ण रूपांकनों को डिड्यूस्ड एमिनो एसिड अनुक्रमों से सफलतापूर्वक पहचाना गया। कई अनुक्रम संरेखण ने दिखाया कि CmiCHS और CmiANS अनुक्रम अत्यधिक संरक्षित थे और अन्य पौधों से चाल्कोन सिंथेस के साथ उच्च अनुक्रम पहचान (> 83%) साझा करते थे। हालांकि, वास्तविक समय मात्रात्मक पीसीआर का उपयोग करके विभिन्न ऊतकों के साथ-साथ टेपल्स (नारंगी और पीले फूल) में इन जीनों की अभिव्यक्ति प्रोफ़ाइल निर्धारित करने के लिए एक और परख की गई थी। सीएमआईसीएचएस और सीएमआईएएनएस की अभिव्यक्ति के स्तर अन्य ऊतकों (पत्तियों, शैली और कलंक और स्केप) की तुलना में टेपल्स में अधिक थे। ऊतकों में जीन के ये अभिव्यक्ति पैटर्न एंथोसायनिन के संचय के अनुरूप थे, जो यह दर्शाता है कि नारंगी और पीले रंग के रंगद्रव्य निश्चित रूप से चाल्कोन सिंथेस और एंथोसायनिन सिंथेस के विनियमन से संबंधित थे।