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ऑस्ट्रेलिया में कोरोना वायरस एनएसपी2 आरएनए टोपोइसोमर्स I120F म्यूटेंट का प्रचुर संचरण, साथ ही D614G स्पाइक प्रोटीन उत्परिवर्तन

असित के. चक्रवर्ती

हमने पहले एनएसपी2 कोरोना वायरस प्रोटीन को विब्रियो हेमोलिटिका डीएनए टोपोइज़ोमेरेज़ IA/IV के साथ-साथ डीएनए प्राइमेज़, डीएनए गाइरेज़ और द्वि-सबयूनिट ट्रिपैनोसोमा ब्रुसेई डीएनए टोपोइज़ोमेरेज़ IB के बीच एमिनो एसिड होमोलॉजी के माध्यम से आरएनए टोपोइज़ोमेरेज़ के रूप में भविष्यवाणी की थी। कई डीएनए टोपोइज़ोमेरेज़ I/III में आरएनए टोपोइज़ोमेरेज़ गतिविधि होती है और ऐसे सर्वव्यापी एंजाइम संरक्षित होते हैं और प्रतिकृति और प्रतिलेखन के नियमन में शामिल होते हैं। हमने यहां एनएसपी2 आरएनए टोपोइज़ोमेरेज़ के उत्परिवर्तन प्रोफ़ाइल की जाँच की है जो >10000 orf 1a 4405 एमिनो एसिड लंबाई वाले कोरोना वायरस पॉलीप्रोटीन का विश्लेषण करता है। BLAST खोज द्वारा उत्परिवर्ती प्रोटीन का चयन किया गया जिसमें 99.84% अनुक्रम समानता थी और 181-818 aa भाग NsP2 प्रोटीन (प्रोटीन आईडी QIU82057) का विश्लेषण CLUSTAL ओमेगा सॉफ़्टवेयर का उपयोग करके किया गया था। हमने 26 अलग-अलग उत्परिवर्तन पाए, जिनमें से अधिकांश परिवर्तन आइसोल्यूसीन और एलेनिन से वैलीन या ल्यूसीन से फेनिलएनालिन में चुने गए थे, जो कोरोना वायरस आरएनए टोपोइज़ोमेरेज़ की संरक्षित प्रकृति को इंगित करते हैं। प्रमुख निरर्थक बहुत प्रचुर उत्परिवर्तन I120F (आइसोल्यूसीन से फेनिलएनालिन) में पाए गए। अन्य महत्वपूर्ण उत्परिवर्तन R27C, I198V, T85I, L410F, I559V और P583S थे। I120F उत्परिवर्तन ऑस्ट्रेलियाई आइसोलेट्स में प्रचुर मात्रा में था और इसका प्रसार बांग्लादेश और अमेरिका जैसे अन्य देशों में देखा गया था। हम सुझाव देते हैं कि Nsp2 टोपोइज़ोमेरेज़ का प्रचुर I120F उत्परिवर्तन कुशल वायरस पैकेजिंग के लिए RNA संरचना को स्थिर करके कोरोना वायरस के संचरण को बढ़ा सकता है। दिलचस्प बात यह है कि स्पाइक प्रोटीन के D614G उत्परिवर्तन के साथ ऐसे उत्परिवर्तन पाए गए, जो संक्रामकता को 70% से अधिक बढ़ाने के लिए जाना जाता है। इसके विपरीत, विश्लेषण किए गए सभी P583S Nsp2 म्यूटेंट में कोई भी D614G स्पाइक प्रोटीन उत्परिवर्तन नहीं था। जीनोम वाइड विश्लेषण द्वारा कई मूक उत्परिवर्तन (5-7) का पता लगाया गया, लेकिन कोई N501Y स्पाइक प्रोटीन उत्परिवर्तन नहीं पाया गया। यह पहली रिपोर्ट है जो Nsp2 प्रोटीन I120F उत्परिवर्तन के साथ अधिक कोरोना वायरस संचरण के लिंक की भविष्यवाणी करती है और नई एंटी-वायरल दवाओं की खोज के लिए महत्वपूर्ण हो सकती है।