सैद्धांतिक और कम्प्यूटेशनल विज्ञान जर्नल
खुला एक्सेस
आईएसएसएन: 2376-130X
आईएसएसएन: 2376-130X
सन्मति के.जे., अचल एम.
के निकटतम पड़ोसी आणविक क्षेत्र विश्लेषण (kNN MFA) विधि का उपयोग करके एक त्रि-आयामी मात्रात्मक संरचना गतिविधि संबंध (3D QSAR) को कार्बोक्साइलेस्टरेज़ (CE) अवरोधकों के रूप में आइसैटिन व्युत्पन्नों की एक श्रृंखला पर किया गया था। यह अध्ययन 49 यौगिकों (डेटा सेट) के साथ किया गया था, जिसमें प्रशिक्षण और परीक्षण सेट में डेटा सेट के विभाजन के लिए क्षेत्र बहिष्करण (SE) एल्गोरिदम का उपयोग किया गया था। SE एल्गोरिदम प्रतिनिधि बिंदुओं द्वारा कब्जा किए गए सभी वर्णनकर्ता स्थान क्षेत्रों को कवर करने वाले प्रशिक्षण सेट का निर्माण करने की अनुमति देता है। 3.0 से 5.5 असमानता स्तरों के बीच जिसमें परीक्षण सेट आकार 4 से 10 शामिल हैं, स्टेपवाइज (SW), सिम्युलेटेड एनीलिंग (SA) और जेनेटिक एल्गोरिदम (GA) के साथ kNN-MFA पद्धति का उपयोग QSAR मॉडल बनाने के लिए किया गया था। SW-kNN MFA (pred_r2=0.7552 से 0.9376) के साथ चार पूर्वानुमान मॉडल तैयार किए गए, SA-kNN MFA (pred_r2=0.7019 से 0.9367) के साथ तीन पूर्वानुमान मॉडल तैयार किए गए और GA-kNN MFA (pred_r2=0.8226 से 0.8497) के साथ दो पूर्वानुमान मॉडल तैयार किए गए। स्टेपवाइज kNNMFA द्वारा तैयार किए गए सबसे महत्वपूर्ण मॉडल ने आंतरिक पूर्वानुमान 82.11% (q2=0.8211) और बाहरी पूर्वानुमान 93.76% (q2=0.9376) दिखाया। इस मॉडल में हाइड्रोफोबिक और स्टेरिक इंटरैक्शन CE निरोधात्मक गतिविधि पर हावी हैं। सकारात्मक रेंज के साथ हाइड्रोफोबिक फील्ड डिस्क्रिप्टर (H_977) इंगित करता है कि सकारात्मक हाइड्रोफोबिक क्षमता गतिविधि में वृद्धि के लिए अनुकूल है और इसलिए उस क्षेत्र में अधिक हाइड्रोफोबिक प्रतिस्थापन समूह को प्राथमिकता दी जाती है। ऋणात्मक श्रेणी के साथ स्थैतिक क्षेत्र विवरणक (S_619) यह दर्शाता है कि ऋणात्मक स्थैतिक क्षमता गतिविधि में वृद्धि के लिए अनुकूल है और इसलिए उस क्षेत्र में कम भारी प्रतिस्थापन समूह को प्राथमिकता दी जाती है। kNN-MFA समोच्च आरेखों ने प्रतिस्थापित आइसैटिन व्युत्पन्नों की संरचनात्मक विशेषताओं और उनकी गतिविधियों के बीच संबंधों की आगे की समझ प्रदान की, जो नए संभावित CE अवरोधकों को डिजाइन करने के लिए लागू होनी चाहिए।