मृदा जैव रसायन मृदा विज्ञान की वह शाखा है जो मिट्टी में कार्बनिक पदार्थों के निर्माण और अपघटन, मिट्टी में कार्बन, नाइट्रोजन, सल्फर, फास्फोरस, धातुओं और ज़ेनोबायोटिक्स की जैव रासायनिक प्रतिक्रियाओं और पौधे-जड़ राइजोस्फीयर की जैव रसायन विज्ञान से संबंधित है। मृदा जैव रासायनिक प्रतिक्रियाएं मुख्य रूप से कार्बनिक अंश पर चिंता करती हैं, हालांकि यह कुल मिट्टी की मात्रा के 55 से बना है।